桐树科研 硕果累累|基因检测助力评估鼻咽癌预后,挖掘潜在标志物

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原文发表在Annals of Translational Medicine

 
 
 

鼻咽癌(NPC)的发病率较低,且具有独特的地理分布特征,在东南亚和中国发病率较为普遍。由于鼻咽的特殊解剖位置,大多数鼻咽癌患者在初诊时被归类为晚期鼻咽癌。虽然鼻咽癌对放化疗的敏感较高,但局部复发和远端转移仍是鼻咽癌治疗失败的主要原因,其占比分别5-15%和15-30%。在2012年,高肿瘤转移率导致约全球5万例鼻咽癌患者死亡。

 

随着调强放射治疗(Intensity-modulated radiation therapy,IMRT)的应用,鼻咽癌的局部控制和鼻咽癌患者的总生存期(OS)得到明显改善。一线含铂化疗是鼻咽癌最常用的治疗方案。IMRT联合顺铂同步放化疗(CCRT)是美国国家综合癌症网络指南(NCCN 2017版)推荐的局部晚期鼻咽癌(LANPC)患者的标准治疗方法。然而,即使是优化的治疗方案,大约5-15%的鼻咽癌患者有局部复发,大约15-30%的鼻咽癌患者因远处转移而失败。

 
 

 

研究结果

 

研究涉及的患者概况

本项研究入组24例患者,其中男性18例,女性6例。患者中位年龄47岁(19-64岁)。24例患者中,临床II期1例,III期7例,IVA期16例。

 

鼻咽癌患者CCRT治疗前后PD-L1的表达变化

患者接受CCRT治疗之后,TPS 评估患者PD-L1表达。7例患者PD-L1的表达无变化,10例患者PD-L1的表达增多,7例患者PD-L1的表达减少;CPS评估患者PD-L1表达,4例患者PD-L1的表达无变化,8例患者PD-L1的表达增多,12例患者PD-L1的表达减少。分析结果提示鼻咽癌患者CCRT治疗后PD-L1表达可能发生改变(图1)。

 

图1. 同步放化疗后PD-L1表达改变的情况

 

鼻咽癌患者的体细胞突变情况

接下来,对接受CCRT治疗的其中18名NPC患者样本进行全外显子组测序 (WES),以评估晚期 NPC 样本中的体细胞变化。来自癌和癌旁的 1,778 个基因中检测到 8,514 个突变,包括最常见的NPC驱动基因突变如:TET2、TP53 和 MAPK。另外分析发现,PD-L1阳性组的肿瘤新抗原负荷(TNB)和肿瘤突变负荷(TMB)的平均值显著低于PD-L1阴性组。此外,我们在 NPC 突变队列中发现了高频突变基因如ARID1B、MED12、CEBPA、TEKT4、TET2 等(图2)。

 

图2. 鼻咽癌中驱动基因的体细胞突变情况

 

结论

 

本研究发现TMB和TNB可能是鼻咽癌治疗的潜在临床指标,PD-L1的表达可能是鼻咽癌放化疗的临床生物标志物。通过NGS测序和注释,我们发现NPC中最常见的驱动基因突变是TET2、TP53和MAPK。本项研究有助于识别新的遗传靶点,为鼻咽癌患者的诊疗提供新的诊疗策略。

 

 

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END

 

 

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